人参TIFY基因家族鉴定与分析

作者:于欣欣; 米要磊; 孟祥霄; 任伟超; 王思嘉; 孙伟; 马伟*
来源:中华中医药学刊, 2022, 40(03): 72-263.
DOI:10.13193/j.issn.1673-7717.2022.03.018

摘要

目的 通过对人参TIFY基因家族的保守基序,系统进化,基因模式表达分析,深入研究TIFY基因功能,为人参优良品种选育提供理论依据。方法 通过生物信息学手段对人参TIFY基因家族进行鉴定和分析,使用TAIR、ExPASy、WOLF PSORT、MEME、NCBI等在线网站以及TBtools、MEGA等软件进行TIFY基因表达模式分析,并进行可视化作图。结果 在人参中共鉴定出33个TIFY基因成员,分别聚类为ZML、PPD、JAZ、TIFY 4个亚家族,其氨基酸数量在104~1064 aa,等电点介于4.96~9.78,分子质量在117 477.88~49 576.63 D之间,大部分被鉴定的基因定位于细胞核中,通过热图对基因的表达分析表明,人参TIFY基因家族在根、根茎、叶、花、果实中表达存在一定的差异性。结论 通过对人参TIFY全基因组水平鉴定及生物信息学分析,推测TIFY基因家族在对人参的生长发育有重要的调控作用,并且可能参与了人参皂苷的生物合成,将为人参的优良品种选育提供理论依据。