BioStarM-140s芯片基因信息查询系统的构建及应用

作者：陆慧琴; 吕晓迎; 包翔; 马慧敏

来源：东南大学学报(自然科学版), 2006, (04): 647-651.

• 生物信息学
• 数据库查询
• 基因表达芯片 bioinformatics
• database searching
• gene expression microarray

应用生物信息学数据库查询的方法,对B ioS tarM-140s小鼠基因表达芯片上的14 112个基因进行相应注释信息的查询和所对应蛋白质功能的分类.首先参照人类综合型芯片上基因的功能分类,设定了14个蛋白质类别,然后采用V isual C++编程语言,构建了基因信息查询系统.应用该查询系统,进行了网络生物学数据库信息资源的自动直接查询,共搜索到有注释信息的基因12 070个;进一步按照所设定的14个蛋白质类别对12 070个基因进行分类查询,搜索到了与这14个分类相符合的、具有详细蛋白质功能注释信息的基因共1 606个.

• 单位
  生物电子学国家重点实验室; 东南大学