基于RAA-Cas13a的猪瘟病毒检测方法的建立

作者:薛俊欣; 韩伟; 朱忠武; 熊炜; 黄忠荣; 李春阳; 赵新宇; 孔祥翔; 李健; 蒋原
来源:中国动物传染病学报, 2021, 1-10.
DOI:10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20210826.003

摘要

灵敏、准确、多样的检测方法对有效防控猪瘟疫情极其重要,为了丰富现有的猪瘟病毒(CSFV)检测技术,本研究拟建立基于RAA-Cas13a的检测方法。基于全序列比对的基础上分别设计1对引物和两条crRNA,对不同浓度的阳性质粒、阳性样品和7种其他猪病病毒样品进行RAA扩增,扩增产物以Cas13a酶切体系进行荧光检测;结果显示,Cas13a酶切体系可以放大普通RAA的检测信号,RAA-Cas13a可以将检测的灵敏度提高至102拷贝/μL,不能检出其他7种猪病病毒,检测变异系数小于5%,临床样本检测结果与荧光RT-PCR一致性高。结果表明,本研究建立CSFV的RAA-Cas13a灵敏度较高、特异性和重复性好,具有推广应用的潜力。

全文