基于肿瘤数据库分析SOX基因家族在肝癌中的表达及预后意义

作者：余水红^*; 李艳; 钱燕; 严其高; 王晓梅; 龚莉

来源：中国生物制品学杂志, 2020, 33(11): 1270-1275.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.003197

• SOX基因家族
• 肝癌
• 预后

目的通过肿瘤数据库分析SOX基因家族在肝癌中的表达,及其对肝癌患者预后的影响。方法采用cBioPortal数据库检索分析SOX基因家族中12个基因在肝癌组织中的突变频率及变异情况;利用Ualcan数据库比较分析肝癌组织及癌旁组织中12个基因mRNA的表达;结合Kaplan-Meier plotter数据库的临床信息进一步分析SOX基因家族中12个基因在肝癌患者中潜在的预后价值。结果 SOX基因家族大多数成员扩增突变,SOX15为缺失突变。SOX4、SOX8、SOX11、SOX12、SOX15、SOX17、SOX18及SOX21基因在肝癌组织中mRNA表达均高于癌旁组织(P <0.05),SOX1、SOX3、SOX14及SRY基因差异无统计学意义(P> 0.05)。SOX1、SOX3、SOX8、SOX14、SOX15、SOX17、SOX18、SOX21及SRY基因在肝癌患者中的表达均上调(HR <1,Logrank P <0.05),利于患者预后;SOX4、SOX11及SOX12基因高表达与患者不良预后相关(HR> 1,Logrank P <0.05)。结论 SOX基因家族与肝癌发生发展密切相关,大部分成员可作为肿瘤患者的预后标志基因。

• 单位
  安庆师范大学; 中心实验室; 生命科学学院; 深圳大学; 安庆医药高等专科学校