维氏气单胞菌TolC蛋白的生物信息学分析

作者：李佳霓; 李娟娟; 马香; 唐燕琼; 刘柱; 李宏^*

来源：中国病原生物学杂志, 2023, 18(05): 502-507.

DOI：10.13350/j.cjpb.230502

• 维氏气单胞菌
• 外膜通道蛋白
• TolC
• 生物信息学

目的 利用生物信息学技术预测和分析维氏气单胞菌TolC蛋白的生物学特性、结构、功能及进化关系，为研究其致病机制以及开发新的疫苗和新的药物靶点提供参考。方法 从NCBI蛋白质数据库中获取TolC序列，使用ProtParam、ProtScale、SignalP5.0、TMHMM2.0、PSORTb、NetPhos3.1、CD-search、SPOMA、SWISS-MODEL、ABCpred、IEDB等生物信息学工具分析和预测TolC蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、保守结构域、亚细胞定位、磷酸化位点、二级和三级结构、B细胞抗原表位和互作蛋白。利用MEGA5.2构建系统进化树，分析不同细菌间TolC蛋白的进化关系。结果 TolC蛋白由439个氨基酸组成，分子式为C2112H3414N600O689S5,是稳定的亲水性蛋白。该蛋白亚细胞定位于细胞外，无跨膜结构域，有信号肽SP(Sec/SPI),含有52个磷酸化位点和多个B细胞抗原表位。蛋白的主要二级结构为α-螺旋，三级结构为同源三聚体。TolC蛋白具有外膜通道蛋白的保守结构域，与B565＿1337、macB等多药外排泵相关蛋白有互作关系。进化分析显示维氏气单胞菌TolC蛋白与嗜水气单胞菌TolC蛋白遗传进化关系最近。结论 维氏气单胞菌TolC蛋白作为多药外排泵的外膜通道蛋白，与细菌致病和耐药性密切相关。该蛋白具有多个B细胞抗原表位，是潜在的药物靶点和疫苗候选蛋白。

• 单位
  海南大学; 生命科学学院