中药淡竹叶与鸭跖草的DNA条形码鉴定

作者：张丹纯; 张靖; 关婉; 曹丽芬; 涂嘉俊; 侯森榉; 丘小惠; 黄志海; 宫璐

来源：分子植物育种, 2022, 1-14.

• 淡竹叶(Lophatherum gracile)
• 鸭跖草(Commelina communis)
• 聚合酶链式反应
• DNA条形码
• NJ系统发育聚类树

筛选4种候选DNA条形码(ITS2， psbA-trnH， matK， rbcL)，找到适合鉴定淡竹叶与鸭跖草的DNA条形码。本研究收集淡竹叶和鸭跖草植物样本各4份、不同地区市售药材各28份，通过ITS2、psbA-trnH、matK及rbcL条形码进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序，所得序列采用CodonCode Aligner进行拼接；同时从GenBank下载30条淡竹叶和鸭跖草序列，利用MEGA 6.0软件分析种内遗传距离，并构建系统进化树。结果表明，参考文库淡竹叶与鸭跖草的种间最小遗传距离远远大于种内遗传距离，NJ系统聚类树能够明显分成两大支。市售药材淡竹叶、鸭跖草ITS2条形码测序成功率低，种内的变异程度较大。基于ITS2、psbA-trnH、matK及rbcL条形码构建市售药材和参考文库的聚类树图，结果均可明显分成两大支，但鸭跖草市售药材中存在疑问。本研究结果表明psbA-trnH、rbcL条形码鉴别淡竹叶与鸭跖草更为稳定，鸭跖草市售药材中可能混有伪品饭包草。

• 单位
  广东省药品监督管理局; 广东省中医院