建立科学公正的生态环境损害鉴定评估制度需要不断完善其运行保障机制。目前,我国生态环境损害鉴定评估机制存在一定的问题,主要表现为监督管理不力、技术规范体系推进缓慢和鉴定评估机构准入标准不一等。对此,可通过建立完善的鉴定评估监督管理机制、构建系统的生态环境损害鉴定评估平台和推进统一的鉴定评估机构准入机制等方式,保障生态环境损害鉴定评估制度科学运行,为我国生态文明建设提供有益支撑。