兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因生物信息学分析

作者:岳丹; 席冬梅; 刘兴能; 任洪辉; 陆颖; 张雪; 何志辉; 邓卫东*
来源:中国畜牧杂志, 2022, 58(03): 92-98.
DOI:10.19556/j.0258-7033.20201105-03

摘要

根据NCBI收录的绵羊SLC17A8(Solute Carrier Family 17 Member 8)基因序列设计特异性引物,利用PCR技术扩增兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因外显子区,经测序后拼接序列,并对编码区序列以及翻译后蛋白序列进行蛋白结构预测。结果显示,兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因编码区长为1 770 bp,编码589个氨基酸。同源性比对显示兰坪乌骨绵羊SLC17A8氨基酸序列与普通绵羊的该基因氨基酸序列同源性达到99.66%,发现有11个突变位点,其中2个错义突变位点,SLC17A8-Exon1 G159A位点编码的氨基酸由Gly(甘氨酸)突变到Glu(谷氨酸);SLC17A8-Exon2 G87A位点编码的氨基酸由Gly突变到Arg(精氨酸)。蛋白结构预测显示,SLC17A8蛋白空间结构主要有α螺旋、β转角和无规则卷曲。

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