姜黄属植物叶绿体基因组特征研究

作者：傅武祥; 张雪梅; 尚宇梅; 罗旋飞; 马占霞^*

来源：种子, 2023, 42(10): 38-49.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2023.10.038

• 姜黄属
• 叶绿体基因组
• 系统发育
• 基原物种鉴定

以8株来源不同的姜黄属植物(3株姜黄，1株莪术，3株郁金和1株川郁金)为实验材料，基于Illumina测序平台，Get-Organelle软件组装出8个植物叶绿体基因组，结合Genbank中下载姜黄属植物叶绿体基因组33条，共得到41个姜黄属叶绿体基因组。姜黄属叶绿体基因组均为四分体结构，序列长度为159 423～163 539 bp, GC含量范围36.2%～36.3%,编码基因为125～133个；姜黄、蓬莪术、郁金和川郁金均含有133个基因，包括38个tRNA、8个rRNA和87个编码蛋白基因；检测到的SSR数量范围为97～128个，散在重复序列均为50个，基因组序列具有丰富的AT含量。基于整个叶绿体全基因组作为条形码构建的系统进化树显示姜黄属不是单系，不过药典中收录的五种姜黄属药材郁金、广西莪术、姜黄、蓬莪术、温郁金与其他姜黄属物种形成一个独立分支，提示这些药用姜黄属植物有非常密切的关系。但由叶绿体基因组建的系统树中一部分没有区分开来的姜黄属物种，有可能是姜黄属通过外形很难鉴定而导致的不准确性或者物种间相互杂交及渐近渗透等原因，需要结合核基因或其他技术手段做进一步鉴定。

• 单位
  滇西应用技术大学; 云南农业大学; 中国科学院西双版纳热带植物园