应用血浆微生物游离DNA测序预测造血干细胞移植患者血流感染病原体

作者：殷冠坤; 韩秉宜; 陈宏斌; 马帅; 王辉^*

来源：中华检验医学杂志, 2022, 45(12): 1267-1274.

DOI：10.3760/cma.j.cn114452-20220722-00430

• 造血干细胞移植
• 血流感染
• 病原体
• 预测
• 微生物游离DNA测序

目的通过血浆微生物游离DNA(mcfDNA)额外扩增和非额外扩增测序, 预测造血干细胞移植(HSCT)患者血流感染(BSI)病原体。方法前瞻性采集2021年3—7月北京大学人民医院978例HSCT患者移植前预处理期至移植后4个月间的7 428份临床剩余血样, 分离血浆并冷冻保存。依据血培养结果和是否留有BSI发病前样本等, 最终共纳入28例血培养阳性(39份BSI发病前1～8天的血浆)和9例血培养阴性(9份血浆)的HSCT患者。39份血浆样本进行mcfDNA额外扩增和非额外扩增测序;9份血浆样本进行额外扩增测序。以血培养结果为金标准, 比较测序结果与血培养结果的一致性。使用Studentt检验和Wilcoxon检验进行统计学分析。结果未经额外核酸扩增的测序分析显示, 仅有7份样本的测序结果与血培养结果一致, 总病原检出率为17.95%(7/39), 发病前3天内和4～8天内的检出率分别为23.81%(5/21)和2/18。主要检出的病原类型为革兰阴性菌(5/7)。而经额外扩增测序的总病原检出率为59.26%(16/27), 且BSI发病前3天内的检出率为8/13。与未经额外扩增测序相比, 额外扩增测序结果中革兰阳性菌的检出增加(13/16), 检测到额外微生物的数量显著增加(t=3.440, P=0.001)。此外, 血培养阴性患者9份血浆样本的额外扩增测序结果显示, 6份样本均未检出病原体, 3份样本仅检出HSCT患者常见的细环病毒。结论 HSCT患者BSI发病前血浆mcfDNA额外扩增测序的病原体检出率优于非额外扩增测序, 且在前3天内的检出率更高, 具有预测BSI病原体的潜能。

• 单位
  北京大学人民医院