变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶操纵子的克隆与分析

作者：宋玉玲; 孙雷; 孙文敬^*; 王大明; 崔凤杰; 齐向辉

来源：食品科技, 2019, 44(07): 43-49.

DOI：10.13684/j.cnki.spkj.2019.07.007

• 变形假单胞菌
• 葡萄糖酸脱氢酶
• 操纵子
• 克隆
• 生物信息学

该研究旨在明确变形假单胞菌JUIM01葡萄糖酸脱氢酶操纵子的结构及其基本的生物学信息。采用LA-PCR技术,从菌株JUIM01中克隆葡萄糖酸脱氢酶操纵子(gad操纵子)的全长序列;利用在线生物信息学工具,对克隆的序列进行分析;通过对变形假单胞菌膜结合葡萄糖酸脱氢酶的组成和结构分析,初步验证克隆和序列分析的结果。研究结果表明,变形假单胞菌gad操纵子具有3个结构基因gndS、gndL和gndC,分别编码膜结合葡萄糖酸脱氢酶的3个亚基。变形假单胞菌gndS基因与解淀粉欧文氏菌CFBP1430葡萄糖酸脱氢酶小亚基的编码基因的序列一致性为59.89%,其编码的蛋白属于gluconate2-dh3 superfamily,为跨膜蛋白;基因gndL与铜绿假单胞菌PAMH19葡萄糖酸脱氢酶大亚基的编码基因的序列一致性为77.68%,其编码的蛋白属于GMCoxredC superfamily,为跨膜蛋白;基因gnd C与香茅醇假单胞菌P3B5葡萄糖脱氢酶中亚基的编码基因的序列一致性达85.31%,其编码的蛋白属于CccA superfamily。该结果为变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶的转录调控机制研究提供了一定的理论基础。

• 单位
  生物工程学院; 江西省德兴市百勤异VC钠有限公司; 江南大学; 江苏大学; 食品与生物工程学院