梅山猪与杜洛克猪卵泡中circ0010513的鉴定及分析

作者：公红斌; 黄涛^*; 谢苏; 邱梅玉

来源：畜牧与兽医, 2020, 52(12): 20-26.

• circ0010513
• 猪
• 卵泡
• 转录组测序

试验旨在探索circRNA在卵泡中可能发挥的潜在作用,为了解circRNA调控卵泡发育的机制奠定基础。采用RNA-Seq和生物信息学方法鉴定梅山猪与杜洛克猪卵泡中circRNA的表达量,运用miRanda、RNAhybrid和targetscan软件,对差异性表达的circRNA进行靶基因预测;对靶基因进行GO和KEGG富集分析,并运用qRT-PCR分析梅山猪和杜洛克猪circ0010513在各时期卵泡及各组织的表达量。结果表明:circ0010513在梅山猪M2卵泡(M2卵泡直径5.1～7.0 mm)中的表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),而梅山猪M1(M1卵泡直径3.1～5.0 mm)卵泡中的表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),该结果与高通量测序结果一致。circ0010513在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管、子宫和子宫角中均有不同程度的表达,其潜在靶基因DUSP5、GADD45G、LAMB3等通过参与繁殖相关的信号通路影响猪的卵泡发育,提示其可能通过对靶基因的调控作用间接参与卵泡发育过程。

• 单位
  石河子大学; 动物科技学院