菊花脑GRAS家族鉴定及其低温胁迫响应表达分析

作者：王同欢; 吴雨馨; 武艺圆; 李鑫鑫; 刘梦阳; 杨莲莲; 李佳鹏; 张忠山; 曹访; 仲雪婷; 王占旗^*

来源：园艺学报, 2023, 50(04): 815-830.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2021-1238

• 菊花脑
• GRAS
• 转录因子
• 低温胁迫
• 表达分析

利用生物信息的方法鉴定了菊花脑（Chrysanthemum nankingense）GRAS基因家族成员，并利用已发表的RNA-Seq数据分析了CnGRAS在低温胁迫应答中的表达情况。结果表明：CnGRAS家族包含80个成员，可分为10个亚家族，同一个亚家族中各成员的基因结构和蛋白功能域高度保守。复制进化分析发现，CnGRAS家族的复制模式仅存在串联重复。GRAS在菊花脑中的表达具有组织特异性，多数在根和叶中表达水平较高。GO富集分析表明CnGRAS主要定位于细胞核，具有多种分子功能，参与多个生物学过程。RNA-Seq数据分析表明，14个CnGRAS至少在1种低温胁迫（短期低温或长期低温）条件下呈现差异表达，其中CnGRAS32、CnGRAS33、CnGRAS40、CnGRAS44、CnGRAS56、CnGRAS74和CnGRAS79呈现出显著上调表达，说明这些基因可能在菊花脑响应低温胁迫中起着重要作用。

• 单位
  生命科学学院; 湖州师范学院