血清lncRNA HOTAIRM1在星型细胞瘤的诊断、预后预测的价值及靶基因预测

作者：李斌; 李娜^*; 刘家东; 李会兵; 罗宝昌

来源：临床神经外科杂志, 2018, 15(04): 261-266.

• HOTAIRM1
• 星型细胞瘤
• 诊断
• 预后
• 靶基因

目的探讨血清HOTAIRM1在星型细胞瘤诊断和预后预测的价值,以及HOTAIRM1的靶基因和靶基因功能。方法选择2013年1月就诊于汉川市人民医院神经外科的3例星型细胞瘤患者,并与3例健康对照者进行比较。对两组的血清样本进行lncRNA芯片分析,筛选差异表达lncRNA。挑选HOTAIRM1,另取2013年1月至2014年1月就诊于汉川市人民医院神经外科的80例星型细胞瘤患者和25例健康对照者的血清标本用qRT-PCR进行验证。评估HOTAIRM1对星型细胞瘤的诊断效能及其表达水平与预后的关系。运用Multi Experiment Matrix(MEM)在线数据库进行HOTAIRM1的靶基因预测,选取排名前50的靶基因进行GO分析和信号通路分析。结果对3例星型细胞瘤患者和3例健康对照者的血清lncRNA表达谱比较分析,共筛选出338个差异lncRNA,筛选出HOTAIRM1进一步分析。与健康对照者相比,星型细胞瘤患者的血清HOTAIRM1呈低表达(log FC=-1.77,P=0.008)。qRT-PCR验证结果示,星型细胞瘤患者的血清HOTAIRM1表达水平(8.5±0.9)明显低于健康对照者(13.8±3.4)(P=0.000)。ROC曲线分析示血清HOTAIRM1预测星型细胞瘤的曲线下面积为0.730(95%CI:0.624—0.836)。患者的性别、年龄、KPS评分与血清HOTAIRM1的表达水平无明显关系(均P>0.05),较高WHO分级患者的HOTAIRM1表达水平明显低于较低WHO分级患者(P<0.001)。HOTAIRM1低表达组的3年总生存率低于HOTAIRM1高表达组,差异有统计学意义(P=0.006)。生物信息学分析示,HOTAIRM1的靶基因主要富集于微小RNA的生物合成(microRNA biogenesis)和RNA调节(regulatory RNA pathways)等信号通路。结论血清HOTAIRM1可作为星型细胞瘤诊断和预后预测的潜在血清标记物;并有助于为今后进一步临床研究和抗星型细胞瘤治疗靶点设计提供参考。

• 单位
  汉川市人民医院