大豆YABBY基因家族生物信息学分析及组织表达模式研究

作者：胡春娇; 梁雪枫; 姜振峰^*

来源：大豆科技, 2023, (06): 9-19.

DOI：10.20095/j.issn1674-3547.2023.06.002

• 大豆
• YABBY基因家族
• 生物信息学
• 转录因子

YABBY基因家族是一类存在于植物体内的转录因子，该基因在植物形态发育中扮演重要角色。为探究YABBY基因家族在大豆生长发育过程中的作用，文章运用生物信息学方法鉴定大豆YABBY基因家族成员，并对其理化性质、系统进化树、蛋白质二级及三级结构、Motif、基因表达模式及共线性关系进行分析。结果表明，大豆YABBY基因家族中共有17个家族成员，分别命名为Gm YABBY1～Gm YABBY17。其氨基酸数量为173～264 aa，等电点为5.30～9.34，部分基因家族成员蛋白质三级结构相同。根据系统发育关系和序列相似性将大豆YABBY基因家族分为4个亚族，为ClassⅠ～ClassⅣ，同一亚族成员保守基序高度相似。通过基因表达分析发现Gm YABBY6和Gm YABBY10在叶片、荚、种子、根及根瘤中均未表达，Gm YABBY1和Gm YABBY4在组织表达中具有较强特异性。物种内共线性分析发现该基因家族发生了14次复制事件，表明在进化过程中大豆Gm YABBY基因出现了基因分化。

• 单位
  东北农业大学