牦牛不同发育时期腿肌中MEF2D基因克隆及组织表达分析

作者:马启财; 武文莉; 张振宇; 王兴东; 叶娜; 阎萍; 潘和平*
来源:基因组学与应用生物学, 2020, 39(12): 5389-5396.
DOI:10.13417/j.gab.039.005389

摘要

为研究牦牛MEF2D基因的结构和功能,检测其在牦牛不同组织及不同时期腿肌发育过程中的表达情况,并且检测不同发育时期的胎牛(4~5月)、6月龄和成年牛(4~5岁)的腿肌,通过RT-PCR方法获得牦牛MEF2D基因全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析,检测其结构和功能。最后采用RT-qPCR技术检测牦牛MEF2D基因在同一时期不同组织中和不同时期腿肌发育过程中的表达特性。结果显示:牦牛MEF2D基因有一个912 bp的开放阅读框,预测编辑303个氨基酸残基。物种的保守性分析发现牦牛MEF2D基因与黄牛的同源性最高,经核苷酸和氨基酸序列比对同源性均高达99.46%和99.67%;而与家犬的核苷酸和氨基酸序列同源性较低,为82.85%和81.76%。qRT-PCR结果显示,MEF2D基因在各组织中均有表达,其中该基因在肌肉和肾组织中的表达相对较高,睾丸、肺中的表达量相对较低;在肌肉不同时期中,MEF2D mRNA的表达水平呈上升趋势,由此推测,MEF2D基因可能与牦牛肌肉的生长发育相关。该研究结果为进一步揭示MEF2D基因的功能和调控机制提供参考资料。

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