杭白芷种质资源遗传多样性的SSR分析

作者：刘倩倩; 叶浩婷; 李放; 王荣婷; 田恩伟

来源：南方农业学报, 2018, 49(03): 418-423.

• 杭白芷
• SSR
• 遗传多样性
• 遗传分化
• 聚类分析

【目的】分析杭白芷种质资源的遗传多样性,为其可持续利用及品种选育研究提供理论依据。【方法】从已发表的18对白芷同属植物当归(Angelica sinensis)SSR引物中,筛选出6对具有较高多态性的引物,对3个杭白芷种群[KZ(昆明)、NZ(南京)和XY(咸阳)]的53份种质材料进行PCR扩增,根据其基因型数据,分别采用Genepop 4.0、Gen ALEx6.4.1和Structure 2.2进行遗传多样性、遗传差异及聚类分析。【结果】6个SSR位点共扩增出37.0个等位基因,平均每个位点的等位基因数(Na)6.2个、有效等位基因数(Ne)1.798个,Shanon信息指数(I)1.802,观测杂合度(Ho)0.245,期望杂合度(He)0.304,基因流(Nm)为1.340。3个种群的遗传多样性存在一定差异,其中KZ种群遗传多样性最高(Na 3.8个,Ho 0.481,He 0.508)。3个杭白芷种群可聚类分成两组,KZ种群独成一组,NZ种群和XY种群聚为一组,表明XY种群与NZ种群亲缘关系较近。XY种群与NZ种群间的遗传分化指数(FST)较低(0.208),表明二者遗传分化程度较低,遗传差异较小;KZ种群与NZ种群和XY种群间的FST均较高(0.510和0.506),表明KZ种群与NZ种群和XY种群遗传分化程度较高,遗传差异较大。【结论】同属不同种的SSR引物具有一定通用性。不同来源地的杭白芷种群间存在一定程度的遗传分化,但总体遗传多样性较低,应加大力度寻找其近缘野生资源,保障白芷种质资源的可持续利用。

• 单位
  医药学院; 广州医科大学附属肿瘤医院; 南方医科大学