摘要
目的 筛选出正常健康人和腹主动脉瘤患者外泌体中表达有差异的非编码RNA(ncRNA),并进行生物信息学分析以了解其内部机制。方法 收集健康对照组和腹主动脉瘤患者的血浆,提取外泌体中的ncRNA并进行高通量测序。表达差异采用DEseq进行评估,并根据|log2(折叠变化)|>1和调整后的P<0.05的标准进行筛选并排序。基于《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)和生物通路与基因本体论(GO)进行功能富集分析。结果 筛选了621种差异表达的ncRNA,显著上调的前10个ncRNA包括MIR1539、MIR3674、SNORD115-47、MIR3188、MIR4443、microRNA 7641-1、MIR4262、SNORD115-18、MIR5096、MIR557;显著下调的前10个ncRNA包括SCARNA13、SNORA11、SNORD3A、RNU4-1、RMRP、RNU4-2、MALAT1、NR144567.1、TALAM1、SNORA73B。发现了与这些基因显著相关的通路,即内质网中的代谢通路、钙信号通路和蛋白加工通路。结论 正常人与腹主动脉瘤患者中外泌体ncRNA的表达有差异,外泌体可能通过激活ncRNA代谢途径和钙信号通路调控腹主动脉瘤的发生与进展。外泌体中某些差异表达的ncRNA可能作为腹主动脉瘤的新型生物标志物。
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