加强自主创新能力建设是转变经济发展方式的根本途径,也是建设创新型国家的重要课题。在分析知识产权公约国民待遇原则发展的基础上,对我国自主创新政策的探索进行梳理,在WTO框架下对自主创新政策与国民待遇原则的关系进行阐释;进而认为,鼓励自主创新与现行知识产权国际保护体系并不矛盾。而如何在一国司法自治内对国民待遇进行解释,是全球化时代实现拓展国内政策空间与履行国际义务间平衡的关键,也是建立鼓励自主创新的知识产权制度所必须回答的问题。