麦红吸浆虫唾腺EST-SSRs的信息分析及分子标记筛选

作者：段云; 吴仁海; 罗礼智; 武予清; 蒋月丽; 苗进; 巩中军

来源：昆虫学报, 2011, (10): 1147-1154.

DOI：10.16380/j.kcxb.2011.10.003

• 麦红吸浆虫
• 表达序列标签
• EST-SSR
• 分子标记
• 多态性 Sitodiplosis mosellana
• expressed sequence tag
• molecular marker
• polymorphism

昆虫EST资源库的扩充为开发新的分子标记提供了宝贵的资源。本研究对NCBI的EST数据库中来源于麦红吸浆虫Sitodiplosis mosellana唾腺的1217条EST序列进行了unigene组装、SSR信息分析和EST-SSR分子标记筛选。结果表明:在1047个unigenes中共找到141个SSR位点,分布于106个(10.12%)unigenes中,平均每3.49kb出现一个SSR位点。在1～6碱基重复基元中,1～3碱基是主要重复类型,占总SSR的97.16%以上。A/T(31.21%),AC/GT(15.60%)和AAC/GTT(9.22%)分别是单、双和三碱基中占优势的重复基元类...

• 单位
  植物保护研究所; 植物病虫害生物学国家重点实验室; 河南省农业科学院; 中国农业科学院植物保护研究所