从同工酶标记对甜瓜起源的研究、DNA分子标记对甜瓜遗传多样性的研究、甜瓜分子遗传图谱构建、甜瓜目标基因定位与DNA分子标记辅助育种、杂种优势分析与预测等5个方面对分子标记在甜瓜育种中的应用情况进行了综述。