本发明属于纳米胶囊技术领域,公开了一种辅酶Q10纳米胶囊及其制备方法与应用。该辅酶Q10纳米胶囊包含以下质量份的组分:蛋白质1~15份、分散剂85~99份、辅酶Q100.1~15份。该辅酶Q10纳米胶囊具有较高的辅酶Q10含量、荷载率、包封率、贮存稳定性、光稳定性、热稳定性、消化稳定性、生物利用率以及易分散;所用的蛋白质来源广泛、成本低,属于环境友好、可降解型乳化剂,对人体无害,甚至具有一定的营养价值。