三种人参属植物的EST-SSR信息分析及其在三七中的应用

作者：杨维泽; 金航; 崔秀明; 沈涛; 杨美权; 张金渝

来源：基因组学与应用生物学, 2011, (01): 62-71.

• 人参属
• 三七
• EST-SSR Genus Panax
• Panax notoginseng
• EST-SSR

为了解人参属植物EST中SSR分布特点及其在三七SSR标记中的应用,利用生物信息学方法,用primer3软件对dbEST数据库中人参属植物人参、西洋参和三七的EST序列进行搜索,发现人参属植物EST-SSR出现频率为11.54%,平均每4.39kb出现1个SSR。人参属植物单核苷酸重复基元占主导地位,其次为三核苷酸重复基元和二核苷酸重复基元,分别占总SSR的54.48%、17.31%和16.36%。人参属EST-SSR的优势类型为A/T和AT/TA,分别占54.73%和8.21%。根据人参属植物EST中的SSR设计48对引物,在合适的PCR扩增体系下,用5个三七样品的DNA为模板进行PCR扩增...

• 单位
  云南省农业科学院药用植物研究所; 昆明理工大学