模拟失重对大肠埃希菌基因表达的影响

作者：李华娴; 韩佩君; 刘勇; 王文岚^*

来源：空军军医大学学报, 2023, 44(01): 18-22.

DOI：10.13276/j.issn.2097-1656.2023.01.004

• 模拟失重
• 大肠埃希菌
• 转录组测序

目的 研究大肠埃希菌在模拟失重条件下连续培养14 d的基因表达变化。方法 利用Gravite重力控制系统模拟失重条件，并在此条件下连续传代培养大肠埃希菌14 d,通过转录组RNA质检和原核转录组RNA建库后进行转录组测序，检测模拟失重条件下大肠埃希菌差异基因的表达。并通过GO和KEGG分析对差异基因进行功能富集分析。结果 模拟失重导致大肠埃希菌基因表达差异，共有229个表达差异显著的基因，差异显著基因的筛选条件为P≤0.05且|log2(Fold Change)|≥1,其中158个为上调基因，71个为下调基因。GO基因富集分析结果显示，差异基因共富集到3个大类中的14个小类。KEGG分析差异基因表达显示，229个差异基因中有69个基因(上调基因47个，下调基因22个)富集于68条通路，大部分为代谢相关通路，主要以上调基因的富集通路为主。结论 模拟失重可引起大肠埃希菌基因表达的变化，从而导致其内部相关代谢通路及生物学性状发生变化。

• 单位
  中国人民解放军空军军医大学