摘要
碱性螺旋―环―螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子作为植物中第二大类转录因子家族,在植物生长发育、信号传导、生物合成以及非生物胁迫等方面发挥重要功能。为了探讨小麦bHLH转录因子在盐胁迫应答中的功能,本研究以冬性小麦‘科农199’为试验材料,通过转录组测序和生物信息学分析的方法对小麦bHLH转录因子在盐胁迫下的表达特性进行系统分析。结果表明,小麦中共有489个bHLH转录因子,分布在21条染色体上;构建系统进化树将bHLH家族进一步划分为9个亚族,其中VI亚族成员最多,IV亚族成员最少;盐胁迫下小麦根转录组测序结果表明,在盐胁迫处理后1h和6h差异表达基因(DEGs)共有44个,其中上调表达的基因有17个,下调表达的基因有27个;GO分析表明,DEGs富集在水盐胁迫,生长素调节等方面;KEGG注释分析表明,DEGs主要富集在淀粉和蔗糖代谢途径,氨基糖和核苷酸糖代谢等信号通路;对部分DEGs进行qRT-PCR验证表明DEGs的表达模式与转录组测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。
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单位生命科学学院; 石家庄市农林科学研究院; 中国农业科学院作物科学研究所; 新疆农业大学