西藏拟溞Daphniopsis tibetana核糖体18S和ITS2序列克隆及进化分析

作者：史楠冰; 赵文^*; 刘卫东; 魏杰; 安浩; 季世琛

来源：生物学杂志, 2018, 35(06): 37-41.

• 西藏拟溞
• 18S rDNA
• ITS2
• 遗传距离
• 进化分析

利用PCR反应扩增出西藏拟溞Daphniopsis tibetana核糖体18S和转录间隔区II (ITS2)片段,经克隆测序后获得其序列,在此基础上研究西藏拟溞分类进化地位。西藏拟溞18S rDNA序列长2296 bp,A、T(U)、G、C含量分别为21.2%、24.4%、29.8%和24.6%; ITS2序列长度平均为1229 bp,A、T(U)、G、C含量平均为28.3%、23.5%、25.5%及22.7%。采用最大似然法(ML)构建的18S rDNA系统进化树显示,西藏拟溞D.tibetana和方角拟溞D.quadrangula亲缘关系最近,在进化树上聚集在同一分支;和溞属的大型溞Daphnia magna在不同分支上,该结果再次证明了西藏拟溞在分类上应归属于拟溞属。与18S rDNA相比,西藏拟溞ITS2序列存在个体间碱基及长度差异,与同科异属物种之间差异更大。获得的西藏拟溞18S rDNA、ITS2序列,为该种进一步的分子水平研究提供了基础数据。

• 单位
  大连海洋大学; 辽宁省海洋水产科学研究院; 生命学院