贵州地方水稻品种抗稻瘟病基因Pita功能区段序列变异分析

作者：杨奕; 马继琼; 孙一丁; 许明辉

来源：分子植物育种, 2018, 16(13): 4129-4137.

DOI：10.13271/j.mpb.016.004129

• 地方水稻品种
• 稻瘟病Pita基因
• 测序分析

为了揭示贵州水稻地方品种Pita基因序列变异类型和地理分布特点,以贵州省收集到的91份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病Pita基因特异引物对Pita基因第二编码区功能位点区段进行PCR扩增及测序分析。研究表明,91份贵州地方水稻均持有抗稻瘟病Pita基因,DNA序列存在6个变异位点,氨基酸序列存在4个变异位点,归为7种DNA单倍型和5种蛋白型,其中Pita-H1(63.74%)、Pita-H2(18.68%)的频率较高,是贵州的优势单倍型,其他单倍型频率较低。携带Pita抗性基因(编码区第2 752位功能位点碱基为G)的品种仅6个,占供试材料的6.59%,且与越南抗性品种Tetep序列一致。Pita抗性基因在贵州省广泛分布不平衡,且频率较低。本研究为挖掘和利用贵州地方稻种的抗稻瘟病基因资源提供了参考。

• 单位
  云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所; 云南省农业生物技术重点实验室; 农业部