红曲霉ABC转运蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析

作者：韩尧; 李燕萍^*

来源：南昌大学学报(理科版), 2023, 47(02): 148-156.

DOI：10.13764/j.cnki.ncdl.2023.02.001

• 基因家族
• 红曲霉
• ABC转运蛋白
• 生信分析

ABC细胞膜转运蛋白是一个能够转运多种底物的蛋白家族，在宿主细胞转运物质的输入和泵出中发挥重要作用。红曲霉(Monascus purpureus went)作为唯一被批准生产食用色素的微生物，但该菌种ABC转运蛋白家族的研究较少。为了揭示红曲霉ABC转运蛋白基因家族的基本信息，利用生物信息学方法对该基因家族进行了分析。共鉴定出了33条红曲霉ABC转运蛋白序列(MsABCs),序列分析表明，大多数MsABCs基因(61.5%)含有1～5个内含子。系统发育分析表明，MsABCs基因分属于7类亚家族。33个MsABCs基因随机分布在22条Scaffolds序列上。顺式元件分析推测，所有的MsABCs启动子序列含有多个胁迫响应顺式元件。这些结果为阐明MsABCs家族的进化关系和进一步研究MsABCs基因的功能特性提供了有价值的信息。

• 单位
  南昌大学; 南昌大学食品科学与技术国家重点实验室; 中德联合研究院