稳定表达HBx的人肝细胞株L02长链非编码RNA表达谱分析

作者：匡栩源; 李宁^*; 傅永明; 李佳; 范学工^*

来源：中华肝脏病杂志, 2016, 24(06): 417-421.

• 癌, 肝细胞
• 肝炎病毒, 乙型
• HBx基因
• 长链非编码RNA
• 微阵列芯片

目的建立稳定表达HBx基因的人肝细胞株L02(L02/HBx)长链非编码RNA(lncRNA)差异表达谱, 筛选出可能在HBV相关肝癌中发挥重要作用的lncRNAs。方法用微阵列基因芯片技术建立lncRNAs差异表达谱, 通过散点图和聚类等分析获得HBx相关差异表达的lncRNAs。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)对部分差异表达的lncRNA进行验证。比较两个芯片组lncRNA的表达值用t检验;对差异表达lncRNA的原始数据进行分层聚类分析。结果与转染空白质粒的对照组(L02/pcDNA3.0)相比, L02/HBx细胞有323个lncRNAs表达上调2倍以上, 421个lncRNAs表达降低50%以上, 差异有统计学意义(P < 0.05)。RT-PCR验证表达上调的4个lncRNAs(TCONS00006195、ENST00000557524、NR037597、ENST00000539975),与表达降低的3个lncRNAs(ENST00000508424、ENST00000447433、uc001lva.4),结果与芯片检测结果相一致。结论成功筛选出HBx相关lncRNAs,为下一步探讨lncRNAs在肝癌发病机制中的作用研究奠定了基础。

• 单位
  中南大学湘雅医院