草鱼(AG)微卫星标记克隆及特征分析

作者：连灏; 石米娟; 杜富宽; 江遥; 黄容; 廖兰杰; 汪亚平; 朱作言

来源：水生生物学报, 2012, (01): 29-34.

• 微卫星
• 三链捕获
• 多态信息含量(PIC) Microsatellite
• Triplex affinity capture
• Polymorphism information content(PIC)

报道了一种简便高效克隆微卫星序列的方法。这一方法的实施步骤包括小片段基因组文库构建、三螺旋捕获、磁珠分离和PCR扫描。草鱼AG重复文库的冗余率为7.2%,富集效率为60.25倍,PCR扫描的准确率达100%,采用这一方法克隆到的AG重复序列中完美型、非完美型和混合型的比例分别为66.87%、17.17%和15.96%,不间断重复序列长度大于30 bp的微卫星座位占51%。34个微卫星座位中有25个表现出多态性,PIC值0.50—0.91,进一步分析表明AG重复序列的多态信息含量(PIC)与不间断重复序列长度相关,不间断重复序列长度大于30 bp的座位表现出丰富的多态性。较高的富集率和有效引物获...

• 单位
  中国科学院水生生物研究所; 淡水生态与生物技术国家重点实验室; 中国科学院研究生院