科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
大蒜含有丰富的含硫化合物，这些化合物均源于半胱氨酸，半胱氨酸合成酶在含硫化物的代谢中占据了重要地位。本研究通过大蒜的转录组数据库分析了118条注释为半胱氨酸合成酶的Unigene，从中找到9条具有全长的序列，使用生物信息学软件预测了其分子量、等电点、疏水性、稳定性系数、跨膜结构域、亚细胞定位，并对这些基因的蛋白结构域、Motif进行了预测，采用多重比较对这9个基因进行了相互比较，与植物中其他的半胱氨酸合成酶序列构建了系统进化树。结果表明，As CS6与As CS2X1在N端存在跨膜结构域，As CS26在N端存在低复杂度区域，其余半胱氨酸合成酶都仅有1个PALP结构域。MEME motif分析表明大多数大蒜半胱氨酸合成酶均有7个motif,As CS26缺少motif 4,As CS2X1缺少Motif 5。As CS2X1在序列中比其他半胱氨酸合成酶多出19个氨基酸残基，As CS2X1与其他半胱氨酸合成酶序列的一致性均小于0.26。系统进化树分析表明植物的半胱氨酸合成酶家族分为了6个亚家族，大蒜的9个半胱氨酸合成酶分布于其中的4组，As CS2X1所在第VI组与其他半胱氨酸合成酶的遗传距离较远，序列相似度低，与已知的PALP亚家族的成员关系也较远，可能是一类新的PALP亚家族成员。大多数半胱氨酸合成酶在根茎叶中均有表达，AsCS5、AsCS6在根中特异表达，AsCS26在茎中表达量高。
- 单位
