烟草铜伴侣蛋白NtATX1基因的克隆、生物信息学及表达分析

作者:张吉顺; 付强; 王仁刚; 张孝廉*; 邱斌
来源:基因组学与应用生物学, 2021, 40(02): 782-787.
DOI:10.13417/j.gab.040.000782

摘要

铜伴侣蛋白ATX (Antioxidant)在维持生命体内铜离子浓度平衡中发挥着重要作用,并且具有一定的镉螯合功能。本研究采用RT-PCR方法从普通烟草中克隆到1个铜离子伴侣蛋白基因,命名为NtATX1。序列分析表明,烟草NtATX1基因的CDS全长354 bp,编码117个氨基酸,包含1个保守的MxCxxC铜离子结合基序,属于HMA亚家族,亚细胞定位于细胞核和叶绿体中,不含跨膜结构域。进化分析显示其与番茄亲缘关系最近。定量PCR结果显示,NtATX1基因在烟草不同组织中均有表达,且在叶片中相对表达量最高,并可受到铜和镉的胁迫诱导,处理后4 d的相对表达量达到最高值,表明其可能在烟草铜离子平衡和镉积累中发挥重要作用。上述结果为后续NtATX1基因的功能研究及利用提供帮助。

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