基于转录组的紫花槭光合色素相关基因筛选与分析

作者：翁卓; 高玉福; 李佳霖; 张佳奇; 陈家硕; 钱东霞; 马艾冰; 黄昭翰; 荣立苹

来源：分子植物育种, 2021, 1-13.

• 紫花槭
• 转录组
• 叶绿素生物合成
• 类胡萝卜素生物合成

为揭示光合色素影响紫花槭（Acer pseudosieboldianum）叶片呈色的分子机制，挖掘与光合色素密切相关的功能基因。本研究基于紫花槭转录组数据，将检测到的Unigene定位到具体的代谢途径分支，对与光合色素有关的KEGG注释编号（KO）进行汇总，得到卟啉与叶绿素代谢途径（ko00860）达27个途径分支，类胡萝卜素生物合成途径（ko00906）有17个途径分支。从中筛选出66条与光合色素相关的差异表达基因（DEGs），其中28条DEGs表达量上调，38条DEGs表达量下调。对筛选到的光合色素相关途径DEGs进行功能预测，在66条DEGs中共筛选出28条结构基因编码了紫花槭光合色素代谢途径中19个关键酶（POR， DVR， NOL， LCYB， NCED， CYP707A等），具体可划分为四类功能。把筛选到的结构基因与KOG数据库中的蛋白序列进行比对并进行GO功能分类统计，富集到数目最多的是生物过程（biological process， BP），其中与代谢过程、单生物过程和细胞过程相关的功能富集最显著。对光合色素相关基因的筛选有助于揭示紫花槭叶色形成分子机制，为今后研究紫花槭基因定位、基因克隆等提供数据支撑。

• 单位
  延边大学