基于Nano LC-MS/MS的板蓝根内源性肽鉴定及活性虚拟筛选研究

作者：刘西京; 张春晖^*; 何利思; 林妙娜

来源：中药材, 2021, 44(05): 1149-1154.

DOI：10.13863/j.issn1001-4454.2021.05.021

• 板蓝根
• 内源性肽
• De novo
• Peptide Ranker

目的：研究板蓝根内源性肽的氨基酸序列及潜在生物活性。方法：采用固相萃取法分离纯化板蓝根的内源性肽，结合Nano LC-MS/MS技术，以de novo法进行氨基酸序列的表征，最后通过Peptide ranker平台，结合DBAASP和CAMPR3平台进行肽段活性虚拟筛选。结果：ALC>50%的肽段共鉴别出195个，>90%的有5个，分别是：Leu-Phe-Asp-Phe、Phe-Thr-Leu-Ser-Arg、Leu-Val-Lys-Pro-Glu-Pro、Acetylation-Lys-Phe-Asp-Phe、Leu-Pro-Glu-Pro-Glu-Pro。选择ALC>60%的131条肽段进行活性预测评价，Peptide Ranker得分>0.80的共有17条肽，与DBAASP和CAMPR3筛选结果具有较高的重合性。结论：板蓝根内源性肽有一定的潜在的抗菌活性，还需进一步验证确认。

• 单位
  应用化学与生物技术学院; 深圳职业技术学院