欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1理化性质与结构的生物信息学分析

作者：曹淑芬; 李文; 何颖; 邹泽红; 李林梅; 艾云灿

来源：中国免疫学杂志, 2016, 32(09): 1291-1298.

DOI：10.3969/j.issn.1000-484X.2016.09.010

• 欧洲女贞
• 过敏原
• 生物信息学软件
• Lig v 1
• 抗原表位

目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1的理化性质和结构,为Lig v 1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(Prot Param)、信号肽(Signal P 4.1 Server)、跨膜区(TMHMM Server v.2.0)、二级结构(GOR4)、MHCⅡ类抗原表位(Net MHCⅡ2.2 Server)、B细胞抗原表位(ProteanTM5.01)以及系统发生树(MEGA 6)。结果:Lig v 1在大肠杆菌中稳定性较好,不存在信号肽与跨膜区;二级结构中无规则卷曲占大多数;Lig v 1潜在MHCⅡ类抗原表位为3044区域;B细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列,也具有不连续的氨基酸序列;Lig v 1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论:大肠杆菌是适合重组Lig v 1的表达系统,Lig v 1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。

• 单位
  呼吸疾病国家重点实验室; 有害生物控制与资源利用国家重点实验室; 广州医科大学附属第二医院; 中山大学生命科学学院