基因芯片技术分析siRNA抑制多效生长因子表达后Pten~(-/-)MEF241细胞基因表达谱的变化

作者：胡迎春; 周乔丹; 张博; 杨柳; 宋博强; 李刚; **昌; 霍艳英

来源：军事医学科学院院刊, 2007, (05): 405-410.

• 寡核苷酸序列分析
• 基因表达
• 基质金属蛋白酶
• 逆转录聚合酶链反应 oligonucleotide array sequence analysis
• gene expression
• matrix metalloproteinases
• reverse transcriptase polymerase chain reaction

目的:应用基因芯片技术,分析siRNA抑制Pleiotrophin基因表达后,Pten-/-MEF241细胞基因表达谱的变化。方法:选用Agilent公司的小鼠oligo芯片,分别提取siRNA抑制Pleiotrophin基因表达前后Pten-/-MEF241细胞的RNA,反转成cDNA,进一步荧光标记后进行芯片杂交,杂交结果经扫描及软件分析,最后Ration值为cy3/cy5(即实验组/对照组)。差异基因筛选标准为正标Ratio(Cy3/Cy5)≥2同时反标Ratio(Cy3/Cy5)≤0.5。部分上调及下调基因的表达水平用RT-PCR及Northern杂交进行了验证。结果:siRNA介导P...

• 单位
  重庆医科大学; 军事医学科学院; 军事医学科学院放射与辐射医学研究所