科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
枫香因其树形优美，入秋后叶色红艳或橙黄，极具观赏价值，是优良的景观生态树种。为了解枫香叶片变色及其次级代谢过程的遗传基础，该文以枫香5个变色期叶片混合样品为材料，利用单分子实时测序技术（PacBio平台）对其进行全长转录组测序。结果表明：（1）全长转录组测序共获得41.04 Gb的高质量数据，从中鉴定出全长非嵌合序列563 180条，通过聚类和去冗余，获得27 269条高质量全长转录本。在27 269条全长转录本中预测到2 035条长链非编码RNA（lncRNA），并检测出14 892个简单重复序列（SSR）位点和1 856个转录因子。（2）基因注释结果表明，NR、GO、COG、KEGG等8个数据库共注释了24 857条转录本，KEGG数据库共获得了124个条代谢途径，主要有核糖体、碳代谢、氨基酸生物合成等，在类黄酮和叶绿素代谢途径中分别有49和71个转录本参与。上述结果初步揭示了枫香叶片变色期转录组信息以及功能特性，为后续研究枫香叶片变色分子机制、色素代谢合成途径和调控、相关功能基因克隆以及叶色改良提供基础数据。
- 单位
