绵羊miR-449a/b前体序列组织表达及生物信息学分析

作者：王赛桥; 赵路; 翟振翰; 张丙雷; 贾万航; 王玉琴^*

来源：中国畜牧兽医, 2023, 50(06): 2175-2184.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.06.001

• 绵羊
• miR-449a
• miR-449b
• 生物信息学
• 靶基因
• 繁殖调控

【目的】探究miR-449a/b在绵羊生长发育和繁殖性能方面的作用，为进一步研究miR-449a/b在绵羊繁殖调控中的作用提供参考。【方法】以湖羊为研究对象，利用实时荧光定量PCR技术鉴定miR-449a/b在湖羊下丘脑、垂体和卵巢中的相对表达量。使用TargetScan、miRWalk、miRDB软件预测绵羊miR-449a/b前体序列的靶基因，利用微生信和KOBAS网站对其进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】试验获得的前体序列与NCBI数据库中绵羊前体序列信息比对结果一致。实时荧光定量PCR结果显示，miR-449a在垂体中的相对表达量显著高于miR-449b(P<0.05),miR-449b在卵巢中的相对表达量极显著高于miR-449a(P<0.01)。利用3个靶基因预测软件做韦恩图分析，取其交集得到miR-449a/b的靶基因数目分别为299和23个。GO功能富集显示，miR-449a/b主要被富集到生物进程；KEGG通路富集结果取前20个通路进行分析发现，主要包括催产素、MAPK等与繁殖调控相关的信号通路。【结论】miR-449a在垂体中的表达量较高，miR-449b在卵巢中的表达量较高。miR-449a/b的靶基因数目分别为299和23个，其基因功能主要集中在生物过程，可能参与湖羊的繁殖调控。

• 单位
  动物科技学院; 河南科技大学