H3K79me3在结直肠癌EMT-MET过程中的作用

作者：翟媛媛; 李前忠^*; 陈颖丽

来源：内蒙古大学学报(自然科学版), 2022, 53(02): 150-157.

DOI：10.13484/j.nmgdxxbzk.20220206

• H3K79me3
• EMT
• MET
• 结直肠癌
• hub基因

上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)及其逆过程间充质-上皮转化(mesenchymal-epithelial transition, MET)是肿瘤转移的关键过程。以结直肠癌(colorectal cancer, CRC)转移期间在EMT和MET之间表达改变相反的基因为研究对象(即在EMT中下调然后在MET中上调的基因(ED-MU)和在EMT中上调然后在MET中下调的基因(EU-MD)),计算并比较了EMT-MET过程中组蛋白修饰水平和基因表达水平的变化，结果发现ED-MU基因启动子中的H3K79me3水平在EMT过程降低然后在MET过程升高。基于组蛋白修饰特征，使用随机森林对与EMT-MET相关的上下调基因进行了预测，结果发现H3K79me3的预测结果最好(AUC=0.974)。通过构建蛋白质相互作用网络确定了10个与转移相关的hub基因。最后，计算了hub基因启动子区组蛋白修饰水平的变化，结果表明H3K79me3可能是hub基因表达的关键调控因子。

• 单位
  内蒙古大学