绵羊miR-376e-3p的靶基因预测与GO功能分析

作者：马元; 胡子乔; 张莹姣; 张雁; 申彩云; 张富权; 刘文忠

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2017, 37(07): 499-503+509.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.2017.07.007

• 绵羊
• miR-376e-3p
• 靶基因预测
• GO分析

[目的]研究miRNA对脂肪代谢的调节作用,在一定程度上揭示脂肪代谢的分子机制。[方法]本研究选取实验室前期高通量测序结果中的miR-376e-3p进行研究,其在不同脂尾型绵羊尾部脂肪组织中差异表达显著,是脂肪代谢的关键miRNA。用3种软件对miR-376e-3p进行靶基因预测,并对预测结果进行GO通路富集分析。[结果]MiR-376e-3p有25个潜在的靶基因,其中21个基因富集到3种分子功能,23个基因富集到14个生物学过程中,其中Vldlr具有脂蛋白粒子受体活性。[结论]推测miR-376e-3p可能通过调节其潜在靶基因Vldlr参与脂肪代谢。为进一步研究miR-376e-3p和Vldlr在绵羊脂肪代谢中的作用奠定了基础。

• 单位
  基因科技有限公司; 山西农业大学; 动物科技学院