笼养鸳鸯肠道微生物组成及其肠道疾病诱因的探讨

作者：张佰莲; 马珺^*; 刘群秀

来源：动物学杂志, 2021, 56(06): 908-917.

DOI：10.13859/j.cjz.202106013

• 肠道微生物
• 多样性
• 肠炎

肠道微生物能够调节动物机体的物质与能量代谢，参与免疫和疾病预防，对于维持动物的正常生理活动至关重要。本研究基于16S rRNA高通量测序，对患肠炎病和健康群组鸳鸯（Aix galericulata）的肠道微生物进行对比，尝试揭示鸳鸯肠炎可能的致病菌。鸳鸯肠道微生物共鉴定出2020个相似度97%的操作分类单元（OTU）。健康组和肠炎组共同的OTU数量为564个。健康组鸳鸯的微生物Alpha多样性指数与肠炎组之间无显著差异（Mann Whitney U test,P> 0.05）。在门水平，鸳鸯的肠道微生物组成以厚壁菌门（Firmicutes）(73.46%)、拟杆菌门（Bacteroidetes）(11.15%)和变形菌门（Proteobacteria）(8.72%)为主。在属水平，丰度最高的类别主要包括狭义梭菌属（Clostridium sensu stricto 1）(29.65%)、库特氏菌属（Kurthia）(24.74%)和乳杆菌属（Lactobacillus）(12.40%)。健康组和肠炎组鸳鸯肠道微生物组成存在显著差异（Adonis,F=3.608 7,P <0.05）。在肠炎组中共筛选出25个相对丰度显著高于健康组的类别，其中，狭义梭菌属、埃希氏志贺菌属（Escherichia-Shigella）和脱硫菌属（Desulfovibrio）的相对丰度最高（线性判别分析LDA值> 5,P <0.05），这3个属的致病菌可能造成肠道微生物群落失衡，机体免疫力下降，是诱发鸳鸯肠炎的重要因素。

• 单位
  上海动物园; 上海农林职业技术学院