甘蓝型油菜重金属ATP酶基因Bn-HMA3的克隆与生物信息学分析

作者：贺晓岚; 王建伟; 王根平; 郝保军; 郭宏伟

来源：分子植物育种, 2022, 1-12.

• 油菜
• 重金属
• Bn-HMA3基因
• 克隆
• 生物信息分析

植物重金属ATP酶(heavy metal transporting ATPase， HMA)参与植物细胞内重金属吸收、转运、富集、分配和解毒等多个过程。本研究以油菜品种‘美国油王88’和‘南油868’为材料，采用同源克隆法PCR扩增Bn-HMA3基因，分别命名为Bn-HMA3-MY88和Bn-HMA3-NY868，并对其进行生物信息学分析。结果表明，Bn-HMA3-MY88和Bn-HMA3-NY868的ORF长度均为2 292 bp，编码763个氨基酸，对应蛋白分子量分别为81.97、81.91 kD，等电点分别为5.69、5.61；蛋白序列含有6个跨膜结构，亚细胞定位预测分析发现该基因主要分布于细胞质膜；功能结构域分析结果证实，两个蛋白都包含有保守的Heavy-metal-associated (HMA)、E1-E2＿ATPase和Hydrolase结构域，属于P-type ATPase家族成员。多序列比对及进化树分析结果表明Bn-HMA3-MY88和Bn-HMA3-NY868与芜菁HMA3 (XP＿009137892.1)氨基酸序列相似性最高，分别为96.73%和96.47%，与拟南芥HMA3 (KAG7545642.1)序列相似性高达87%以上。本研究结果为进一步研究Bn-HMA3-MY88和Bn-HMA3-NY868基因在重金属吸收、转运和累积过程中的功能和机制提供基因资源。

• 单位
  凯里学院; 河北省农林科学院谷子研究所