基于新时代信息技术迅速发展及习近平总书记提出的"三个区分开来"的现实背景,本文在梳理相关文献的基础上,首先阐述了新时代"三个区分开来"下审计创新的理论基础——委托代理理论、国家治理理论和新公共管理理论,其次从审计目标和审计依据两个方面进行了基本理论分析,进而剖析了审计创新路径——审计理念创新、审计判断标准创新、审计技术方法创新。最后提出相关保障机制。文章为新时代"三个区分开来"下的审计创新实践提供了理论支撑。