基于SLAF-Seq技术的广金钱草SNP位点开发及遗传分析

作者：唐晓敏; 张春荣; 周良云; 李龙明; 罗碧^*; 杨全^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(18): 6101-6107.

DOI：10.13271/j.mpb.018.006101

• 广金钱草(Desmodium styracifolium)
• SLAF-seq
• SNPs标记
• 遗传多样性

为分析不同来源广金钱草的遗传关系,本研究利用SLAF-seq技术对来自广东、广西、海南的20份广金钱草样品进行测序,共获得SLAF标签322 360个,鉴定到72 395个多态性SLAF标签。进行过滤后开发得到SNP多态标记220 704个,分析得到94 505个高一致性的群体SNP。通过对20份不同来源的广金钱草个体完成系统进化树、群体结构分析,结果表明,20份广金钱草来源于同一祖先,但由于地理隔离的影响使得个体间发生了遗传分化。通过系统进化树分析发现分布在广东、广西及海南琼中、屯昌的广金钱草具有较近的亲缘关系。研究结果为种质保护和遗传改良提供参考。

• 单位
  国家中医药管理局; 广东药科大学; 云浮市南领药业有限公司