随着《预算法》与新《政府会计准则》的逐步落实与深化,我国事业单位必须在政策导向下,建立全面的预算管理体系,并充分利用预算工具优化资源配置,提升单位管理水平。但事业单位公共收支内容较为复杂,且单位承担着经济效益和社会效益双重职能,在预算管理实践过程中存在着一定的难度。本文以事业单位为主体,分析全面预算管理应用过程中存在的问题,并依据问题提出相应的对策。