香椿染色体核型分析及SSR分子标记开发

作者：于鹏飞; 孙晓健; 李晨晨; 张旭; 郑威; 刘常金^*

来源：园艺学报, 2019, 46(06): 1172-1182.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0903

• 香椿
• 染色体
• 核型分析
• SSR
• 转录组

对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发。染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条,为2A型,香椿的染色体较为原始,变异较小。转录组测序结果共获得66921条Unigene,从中检索得到13 324个SSR位点,分布于11 184条Unigene中,SSR出现频率为19.91%,平均分布距离为3.84 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,分别占SSR总数的62.33%、19.66%和15.99%,单核苷酸A/T为优势重复基元,占总SSR的62.23%,二核苷酸以AG/CT为主要重复基元,占总位点的10.31%,三核苷酸以AAG/CTT为主要重复基元,占4.85%。利用Primer 3.0设计了8 218对引物,随机选取了19对引物对17个香椿种质进行PCR扩增,6对引物显示出可重复的多态性。

• 单位
  天津科技大学