基于支持向量机递归特征消除筛选急性心肌梗死相关免疫基因诊断急性心肌梗死的价值

作者：杜亚娟; 赵恩法; 张玉顺^*

来源：心脏杂志, 2020, 32(05): 471-497.

• 急性心肌梗死
• 免疫基因
• 支持向量机
• 递归特征消除
• 诊断

目的基于支持向量机(SVM)递归特征消除(RFE)(SVM-RFE)筛选急性心肌梗死(AMI)相关的关键免疫基因,并探讨其在AMI中的诊断价值。方法通过基因芯片表达数据库(GEO)获取AMI患者基因表达芯片数据集GSE66360。通过SVM-RFE筛选AMI相关的免疫基因,进而用受试者工作特征(ROC)曲线评估其对AMI的诊断价值。结果共得到66个差异免疫基因,基于SVM-RFE最终得到8个免疫基因用于构建SVM分类器,该基因分类器在探索队列(AUC=0.998)和验证队列(AUC=1.00)中都具有极好的预测AMI的能力。通路富集分析特征基因主要参与血管平滑肌细胞增殖的调控及血管动脉硬化等过程。结论本研究识别出8个关键的免疫基因,发现其在AMI诊断中的潜在作用,并将增进对AMI发生的分子机制的了解。

• 单位
  西安交通大学第一附属医院