湖南省新冠肺炎新版成人预防方干预新型冠状病毒肺炎的网络药理学研究

作者：姚昆鹏; 刘起立; 张道平; 刘佑晖; 蔡虎志; 陈新宇^*

来源：湖南中医药大学学报, 2022, 42(05): 785-793.

• COVID-19
• 湖南省
• 新冠肺炎新版成人预防方
• 网络药理学
• 分子对接
• 核心靶蛋白
• 信号通路

目的 采用网络药理学及分子对接技术研究湖南省新冠肺炎新版成人预防方干预新型冠状病毒肺炎（corona virus disease 2019, COVID-19）的药物成分、作用靶点及潜在通路。方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库筛选湖南省新冠肺炎新版成人预防方的活性成分及药物作用靶点，应用GeneCards等平台检索COVID-19的疾病靶点，采用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物-成分-靶点”网络图，运行STRING数据库进行靶蛋白质相互作用（protein-protein interaction, PPI）分析，使用R语言数据包进行基因本体功能富集（gene ontology, GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomics, KEGG）富集分析，预测其潜在机制，运用AutoDock Vina 1.5.6和PyMol 2.4.0软件对湖南省新冠肺炎新版成人预防方中的关键活性成分与PPI中的核心蛋白进行分子对接验证。结果 经过筛选，得到湖南省新冠肺炎新版成人预防方的有效成分198种，涉及靶标175个，“药物-成分-靶点”图中筛选出94个交集基因。PPI网络显示，湖南省新冠肺炎新版成人预防方干预COVID-19主要涉及PTSG2、HSP90AA1、ESR1等核心蛋白，共有靶标的GO及KEGG富集分析结果主要涉及炎症-免疫调节、胞内信号转导、细胞凋亡、基因调控等多种生物学途径以及IL-17、TNF、HIF-1、AGE-RAGE等相关通路。分子对接验证提示槲皮素与核心靶蛋白MAPK3结合情况最佳，MAPK3为与关键化学成分结合活性最优的靶蛋白。结论 湖南省新冠肺炎新版成人预防方中主要化学成分可能作用于MAPK3、MAPK1、TP53、AP-1、p38等多种核心靶蛋白，激活/抑制IL-17、TNF等信号通路，介导炎症-免疫调节等生物学过程，从而发挥干预COVID-19的作用。

• 单位
  湖南中医药大学; 湖南中医药大学第一附属医院