单细胞水平解析人牙龈间充质干细胞异质性

作者：吴昊; 刘紫微; 郑颖; 戴雅文; 时权^*

来源：生物技术通报, 2023, 39(07): 325-332.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-0253

• 牙龈干细胞
• 单细胞测序
• 细胞亚群
• 功能异质性

利用单细胞转录组测序解析牙龈干细胞（gingival mesenchymal stem cells, GMSCs）内部功能亚群及异质性。体外分离培养、鉴定人GMSCs，利用10×scRNA-seq平台对GMSCs进行单细胞测序，根据细胞的基因表达差异进行分群，分析各亚群表面标记物表达情况，比较各亚群的细胞周期差异，成骨、成脂、成软骨分化基因表达差异以及基因表达谱差异，并分析各亚群细胞间的相互作用。成功提取到人GMSCs，呈旋涡状贴壁生长。单细胞测序分析结果显示GMSCs由9个细胞亚群构成，高表达表面标记物ENG、NT5E、THY1、ITGB1和CD44，阴性表达CD34、CD14、PECAM1、PTPRC。GMSCs总体G2/M期所占比例为41.59%；亚群6的G2/M期比例最低（16.44%）；而亚群2最高（99.08%）。成脂、成软骨、成骨相关基因在9个细胞亚群中的表达不完全相同；9个亚群具有不同的基因表达谱，亚群2/4具有较高的相似性，相对高表达TOP2A、UBE2C、KPNA2、CENPF等基因；亚群5高表达DKK1、KRT7、ID1等基因；亚群9高表达MALAT1、FN1、NEAT1等基因。GO分析显示各个亚群富集不同的通路。亚群9与其他亚群间的通讯最为活跃。单细胞水平研究提示GMSCs存在不同的功能亚群，且各个亚群的增殖能力、基因组表达谱具有异质性。

• 单位
  解放军总医院