大蒜农艺性状与SSR遗传多样性关联分析

作者：李菊; 杨亮; 苗明军; 李志; 王海平; 王培; 李跃建; 常伟^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(23): 7857-7867.

DOI：10.13271/j.mpb.020.007857

• 大蒜(Allium sativum L.)
• 农艺性状
• SSR
• 遗传多样性
• 关联分析

为挖掘与大蒜重要农艺性状相关联的分子标记，本试验选用7对有多态性的SSR引物对158份大蒜种质材料进行遗传多样性分析，利用Structure 2.3.4软件分析群体遗传结构，并采用Tassel 3.0软件中一般线性模型(GLM)进行大蒜12个农艺性状与SSR标记的关联分析。结果显示，12个农艺性状差异明显，其中单头鳞茎重变异系数最大。7对SSR引物共检测到44个等位位点，平均每对引物6.286个；Shannon信息指数(I)分布范围为1.074～1.568，平均值为1.323；引物多态性信息含量(PIC)分布范围为0.563～0.749，平均值为0.640。聚类分析将该群体分为3类，从亚类群Ⅲ-1、Ⅲ-2中筛选出4份鳞茎高产的大蒜材料；群体遗传结构分析也将该群体分为3类。关联分析共检测到3个与大蒜重要农艺性状显著相关联的标记(P<0.05或P<0.01)，表型变异的解释率为4.78%～25.78%，平均为13.43%。本试验筛选出的4份大蒜材料有助于鳞茎高产大蒜专用品种的选育，获得的大蒜农艺性状相关联位点可为大蒜的分子标记辅助育种提供参考。

• 单位
  四川省农业科学院园艺研究所; 中国农业科学院蔬菜花卉研究所